Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc83Q9D4V3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms