Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syce1Q9D495 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Syce1Q9D495 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms