Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4933436I01RikQ9D3T1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4933436I01RikQ9D3T1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms