Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Katnal2Q9D3R6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Katnal2Q9D3R6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms