Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hacd2Q9D3B1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hacd2Q9D3B1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms