Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D2Q3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9D2Q3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms