Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fndc8Q9D2H8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Fndc8Q9D2H8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Fndc8Q9D2H8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Fndc8Q9D2H8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Fndc8Q9D2H8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Fndc8Q9D2H8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fndc8Q9D2H8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms