Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9D1F3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms