Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl28Q9D1B9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl28Q9D1B9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms