Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syf2Q9D198 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syf2Q9D198 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms