Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hddc3Q9D114 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms