Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pbdc1Q9D0B6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pbdc1Q9D0B6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms