Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CenpnQ9CZW2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CenpnQ9CZW2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms