Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
3110001I22RikQ9CZ70 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms