Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prdm5Q9CXE0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prdm5Q9CXE0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms