Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psmd8Q9CX56 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms