Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ddx28Q9CWT6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ddx28Q9CWT6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ddx28Q9CWT6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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