Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ly6kQ9CWP4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms