Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdca4Q9CWM2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdca4Q9CWM2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms