Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctnnbl1Q9CWL8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ctnnbl1Q9CWL8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Ctnnbl1Q9CWL8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Ctnnbl1Q9CWL8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms