Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atxn3Q9CVD2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atxn3Q9CVD2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms