Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms