Protein–RNA interactions for Protein: Q9CT10

Ranbp3, Ran-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp3Q9CT10 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ranbp3Q9CT10 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms