Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rprd1bQ9CSU0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rprd1bQ9CSU0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms