Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q9CR55 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CR55 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CR55 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CR55 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q9CR55 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q9CR55 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9CR55 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9CR55 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9CR55 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms