Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ska2Q9CR46 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ska2Q9CR46 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms