Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tma16Q9CR02 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tma16Q9CR02 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms