Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifitm3Q9CQW9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms