Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim8Q9CQQ0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Smim8Q9CQQ0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Smim8Q9CQQ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim8Q9CQQ0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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