Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rwdd1Q9CQK7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rwdd1Q9CQK7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms