Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms