Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTRAFQ9CQE8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RTRAFQ9CQE8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms