Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ergic3Q9CQE7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ergic3Q9CQE7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms