Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Rpl39lQ9CQD0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rpl39lQ9CQD0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rpl39lQ9CQD0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rpl39lQ9CQD0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rpl39lQ9CQD0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rpl39lQ9CQD0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rpl39lQ9CQD0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rpl39lQ9CQD0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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