Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Itgb3bpQ9CQ82 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms