Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nudcd2Q9CQ48 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nudcd2Q9CQ48 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nudcd2Q9CQ48 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nudcd2Q9CQ48 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nudcd2Q9CQ48 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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