Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
StambpQ9CQ26 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
StambpQ9CQ26 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms