Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Commd4Q9CQ02 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms