Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ3

Uncharacterized protein C1orf185 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPZ3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CPZ3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CPZ3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms