Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt88Q9CPR6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt88Q9CPR6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms