Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe41Q99PV5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms