Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smim3Q99PE5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smim3Q99PE5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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