Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcg3Q99P81 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms