Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tsnaxip1Q99P25 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms