Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Brms1Q99N20 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Brms1Q99N20 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms