Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf17Q99MV7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf17Q99MV7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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