Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SrrtQ99MR6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrrtQ99MR6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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