Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bbc3Q99ML1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bbc3Q99ML1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms