Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cstf3Q99LI7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cstf3Q99LI7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms