Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nmd3Q99L48 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms